Les médicaments de Micro-Immunothérapie se présentent sous forme de gélules séquentielles. Les trois plaquettes contenues dans la boîte disposent d’une numérotation. Il faut suivre cette numérotation lors de la prise du médicament, en commençant par la gélule numéro 1 jusqu’à la gélule numéro 10. Lorsque le premier blister est terminé, il faut prendre le blister suivant, en commençant, à nouveau par la gélule numéro 1. Les gélules doivent être ouvertes, et leur contenu (les petites granules) doit être versé sous la langue pour permettre un contact avec la muqueuse sublinguale. Idéalement, le médicament doit être pris le matin, à jeun. Si cela n’était pas possible, il peut être pris soit 15 à 30 minutes avant le repas ou une heure après le repas.